El 31 de mayo de 2007 la Universidad de Guanajuato adoptó un nuevo modelo organizativo y académico Departamental, Matricial y Multicampus, con dos subsistemas: de NS y de NMS
En el año 2006, y como fruto de un intenso proceso de consulta y opinión, la comunidad universitaria decidió adoptar un nuevo modelo académico y administrativo, que estuviera caracterizado por la organización y el funcionamiento departamental y matricial de su subsistema de educación superior, y por la integración de un subsistema de nivel medio superior con sus 10 escuelas de ese nivel.
Como culminación legal de dicho proceso, el 31 de mayo del 2007, la LX Legislatura Constitucional del Estado aprobó por unanimidad la nueva Ley Orgánica de la Universidad de Guanajuato, que sigue vigente a la fecha.
Uno de los efectos inmediatos de la entrada en vigor del decreto fue que el rector de la Institución, Dr. Arturo Lara López, adquirió el rango de rector general.
